Dirección General. Conformado por el director, tiene a su cargo las funciones generales de representación, gestión, coordinación y administración general de los proyectos y actividades del instituto.

Consejo Directivo. Dirección mayor de las funciones del Instituto.

Comité Asesor. Conformado por profesores de facultades, tienen la función de Asesorar a la dirección del instituto en aspectos relacionados con proyectos y actividades desarrollados por el Idea-UN.

Secretaria. Tiene a su cargo las funciones generales de secretaria.

Centro de Documentación. Actualmente orienta sus actividades al desarrollo de servicios de información para facilitar la investigacion; para ello selecciona, organiza, difunde y genera informacion especializada en el área ambiental.

Asistente Administrativa. Funciones secretarial y de recepción, Manejo Financiero y de Recursos del Instituto (ingresos y egresos del instituto, inventarios de materiales y suministros, personas que prestan servicios profesionales y administrativos). Asistencia administrativa, financiera y contable a los proyectos que desarrolla el Idea-UN.